这下两人都听明白了，竟然是这样，不过星野还有一些疑问……
“超梦怎么会失忆，而且为什么会和你交换身体，可以说说吗？”
“我也很想知道。”
莉莉艾对此也是充满好奇，虽然弗拉达利已经被击败，但当初日记中，还有着一些东西没有解释清楚。
看着两人，皮卡丘点了点头，因为这些事他们有权知道，不过还得从一年前开始说起了……
当时密阿雷市就已经因闪焰队的扩张，开始混乱起来，它虽然通过自己敏锐的侦探直觉察觉到了这点，但并没有去调查，手上事情比较多，也相信官方的人也重视的。
可直到某天，玛琪艾儿突然找了过来，说柚丽嘉被一帮奇怪的家伙带走了，而她是就近逃过来的，因为帅哥不在家，她只能找皮卡丘帮忙。
因为两人和皮卡丘关系很不错，于是它便帮着急地忙开始调查起来，可惜一连好几天，什么都没有找到，在这期间玛琪艾儿也失踪了……
可没想到几天过去，失踪的两人却突然又回来了，而且还跟无事发生一样，甚至玛琪艾儿也完全忘记委托皮卡丘帮忙的事，非常奇怪。
这些事让皮卡丘察觉到了异常，可惜不管怎么找都没有找到线索，直到某天芙拉梅尔到来委托它调查MEGA进化时，提到了闪焰队的事。
这一下子就让它打开了思绪，但它也知道了这个组织的强大，避免自己暴露大侦探皮卡丘的身份，就将所有东西都放在家里，独自前往调查。
没想到这一查，竟发现了惊人的阴谋，它看到玛琪艾儿和柚丽嘉失忆的真相，因为前者可以方便监视国际警察，后者可以方便监视希特隆。
于是她们就被选做了目标，并成为了E战斗服的实验对象，而玛琪艾儿那天在逃离后，其实是先去了警局报案，然后才来皮卡丘侦探事务所。
但警局都是闪焰队的人，她当时离开时就被跟踪了，接着被库瑟洛斯奇用乌贼王抹去了那段记忆。
而这也是为什么皮卡丘在开始调查后，什么都没找到的原因，因为它在那之后也被监视了……
知道了这些，它潜入闪焰队基地，继续深入调查，最后在地下试验场发现被装在罐子里的破坏之茧和超梦，虽然非常震惊，但作为朋友的它第一时间就想着救对方出来。
但没想到在它打破罐子，准备唤醒对方的瞬间，闪焰队也发现了它，直接操控破坏之茧释放暗黑气场，就要将它生命夺走然后变成石头。
可它怎么会这样坐以待毙呢，直接就和伊裴尔塔尔打了起来，不过打只是假象，它真正的目的是救超梦离开，于是释放全部电流假装攻击伊裴尔塔尔，实际上是为了电醒超梦。
但也因此如此，它被伊裴尔塔尔的死亡之翼直接击中，醒来的超梦看到了它生命被
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